Macでもほぼ同じ方法で実現できたのでメモ。
ただし、Macの場合、ターミナルから起動する必要がある。
$ open -n /Applications/hoge.app
で、起動したあと、Application.xmlを書き換えてもう一度同じコマンドを実行することで、2つめを起動させることができる。IDが重複しなければいくつでも可能。
Macの場合は
/Applications/hoge.app/Contents/Resource/META-INF/AIR/Application.xml
にApplication.xmlがあるので、Windowsのときと同じくIDを適当にユニークにしてやればOK。
ちなみに
/Applications/hoge.app/Contents/MacOS/hoge &
で複数起動させようとしたらやたら不安定になった。注意。